雜交篩選——cDNA序列作為探針 WHATMAN 3MM濾紙的應(yīng)用
1.如上述將文庫鋪平板,噬菌斑雜交實驗用E.coli宿主菌株Y1088。
2.噬菌斑于42℃生長過夜。
3.從溫箱取出平板,置4℃冷卻至少1h。
4.膜剝離:首先,用軟鉛筆在干的硝酸纖維素濾膜上給準備影印的平板編號。其次,從平板的中央開始向邊緣小心將濾膜鋪在菌臺上。當(dāng)濾膜完全變濕后(顏色變灰),再等30s。同時,用針頭在平板上標(biāo)出濾膜的3個不對稱位置。小心將濾膜從平板上剝離,接觸面向上放在一張干凈的Whatman 3MM濾紙上。在進行下一步驟之前,所有的平板重復(fù)步驟4。
5.將濾膜接觸面向上漂浮在變性液(0.5 mol/L NaOH; 1.5 mol/LNaCl)中5min。
6.中和5min。
7.用2×SSC洗滌5min。
8.將濾膜放在一張新的Whatman3MM濾紙上,用鉛箔將濾膜和濾紙一起包住。
9.在真空爐中80℃烘烤2h。
10.用6×SSC預(yù)先短暫地濕潤濾膜,然后用預(yù)洗液(50 mmol/LTris-Cl pH8.0; 1mol/L NaCl; 1mmol/L EDTA; 0.1%SDS)于68℃預(yù)洗滌至少1h。用一個盤子放在水浴搖床上。
11.將25張濾膜轉(zhuǎn)移到一個裝有50ml雜交液(5×SSPE;1×Denhardt’s液;100μg/ml cT-DNA;0.1%SDS)的貯存罐內(nèi)(直徑至少90mm),68℃預(yù)雜交2h。
12.對于每ml雜交液,2倍的105至1×106cpm的雙鏈探針經(jīng)沸水浴變性10min后,迅速放冰上冷卻。
13.變性探針立即加到預(yù)雜交混合液中。
14.在封口的貯存罐內(nèi)于68℃雜交過夜,不斷地晃動以防濾膜粘在一起。
15.雜交結(jié)束后,濾膜用2×SSC,0.01%SDS于室溫洗滌3次約1h。
16.將潮濕(防止干燥)的硝酸纖維素濾膜放在一張硬紙或X光片上,用放射性墨水在針頭標(biāo)簽上作標(biāo)記。
17.濾膜用塑料包裝袋(如Saran)包住,然后加上增感屏在X光片上于-70℃曝光過夜。